간단하게 ① 바이러스(virus), ② 세균(bacterium), ③ 진균(fungus), ④ 원충(원생동물, protozoa)으로 분류할 수 있습니다.
기생충의 경우 형태학적으로 원충(protozoa)과 연충(helminths)로 구분할 수 있습니다. 원충은 단세포생물로 미생물 범주에 포함되지만 연충은 조직과 기관이 발달된 다세포 기생충군으로 미생물에 포함되지는 않습니다.
미생물학, 기생충학이 따로 존재하는 것도 바로 기생충 전부가 미생물은 아니기 때문일 것입니다.